Pubchem MCP -palvelin

Mitä “Pubchem” MCP -palvelin tekee?

Pubchem MCP (Model Context Protocol) -palvelin toimii siltana tekoälyavustajien ja PubChem API:n välillä mahdollistaen saumattoman perustietojen hakemisen lääkkeistä ja kemikaaleista. Integroimalla tämän palvelimen, tekoälyjärjestelmät voivat automaattisesti hakea molekyylitietoja, synonyymejä, tunnisteita ja muuta olennaista metadataa kemiallisista yhdisteistä suoraan PubChemista. Tämä ominaisuus tehostaa kehitysprosesseja esimerkiksi lääkeaineiden löytämisessä, bioinformatiikassa ja kemiallisessa informatiikassa automatisoimalla datan hakua, vähentämällä manuaalista etsintää ja mahdollistamalla kehittyneet datavetoiset toiminnot tekoäly-ympäristöissä. Palvelin on suunniteltu helppoon integrointiin ja sitä voi käyttää monilla MCP-standardia tukevilla alustoilla ja työkaluilla.

Kehotekuvalistaus

Repositoriossa ei mainita erillisiä prompt-pohjia.

Resurssilistaus

Repositoriossa ei ole mainittu erillisiä resursseja.

Työkalulistaus

Repositorion server.py-tiedostossa tai dokumentaatiossa ei ole kuvattu erillisiä työkaluja.

Tämän MCP-palvelimen käyttötapaukset

• Automaattinen kemiallisten tietojen haku: Nouda välittömästi kemialliset ominaisuudet, tunnisteet ja rakenneaineistot mille tahansa lääkkeelle tai yhdisteelle – tehosta tutkimusta ja tuotekehitystä.
• Lääketiedon haku: Tarjoa käyttäjille tai tutkijoille kattavat tiedot tunnetuista lääkkeistä, mukaan lukien synonyymit, molekyylikaava ja PubChemin linkit.
• Integraatio bioinformatiikan työnkulkuihin: Anna tekoälypohjaisille työnkuluille mahdollisuus hyödyntää auktoritatiivista kemiallista tietoa esimerkiksi lääkeuudelleenkäytön tai vuorovaikutusanalyysin tueksi.
• Tuki opetustyökaluille: Mahdollista oppimisalustoille rikas, reaaliaikainen kemiallinen tieto opetukseen ja demonstraatioihin.
• API-pohjaiset sovellukset: Taustatuki web- tai mobiilisovelluksille, jotka tarvitsevat ajantasaista kemiallista tietoa ilman manuaalista API-hallintaa.

Kuinka asennat palvelimen

Windsurf

1. Esivaatimukset: Varmista, että Python 3.10 ja riippuvuudet (python-dotenv, requests, mcp, uvicorn) on asennettu.
2. Kloonaa ja asenna:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Muokkaa asetuksia: Avaa Windsurf-asetukset ja lisää Pubchem MCP -palvelin:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Tallenna ja käynnistä uudelleen: Tallenna muutokset ja käynnistä Windsurf uudelleen.
5. Varmista toiminta: Testaa kyselemällä tunnettua lääkettä.

Claude

1. Esivaatimukset: Asenna Python 3.10 ja vaadittavat paketit.
2. Kloonaa ja asenna:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Konfiguroi Claude: Lisää Claude Desktopin servers_config.json -tiedostoon:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Käynnistä Claude uudelleen.
5. Varmista toiminta: Testaa lääkekyselyllä.

Cursor

1. Esivaatimukset: Python 3.10 ja riippuvuudet asennettu.
2. Kloonaa ja asenna:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Lisää MCP-palvelin: Päivitä Cursorin asetustiedosto:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Käynnistä Cursor uudelleen.
5. Testaa: Etsi tunnettu yhdiste.

Cline

1. Esivaatimukset: Asenna Python 3.10 ja riippuvuudet.
2. Kloonaa ja asenna:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Muokkaa asetuksia: Lisää seuraava kohtaan servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Käynnistä Cline uudelleen.
5. Varmista asennus: Vahvista testaamalla esimerkkikyselyllä.

API-avainten suojaaminen

PubChem API:n käyttö ei vaadi API-avaimia nykyisessä kokoonpanossa. Jos tarvitaan, ympäristömuuttujat voi määritellä näin:

{
  "env": {
    "PUBCHEM_API_KEY": "your_api_key"
  },
  "inputs": {}
}

Kuinka käyttää tätä MCP:tä työnkuluissa

MCP:n käyttö FlowHuntissa

Integroi MCP-palvelimet FlowHunt-työnkulkuun lisäämällä MCP-komponentti työnkulkuun ja yhdistämällä se tekoälyagenttiin:

Klikkaa MCP-komponenttia avataksesi konfiguraatiopaneelin. Järjestelmän MCP-asetuksissa syötä MCP-palvelimen tiedot seuraavassa JSON-muodossa:

{
  "pubchem": {
    "transport": "streamable_http",
    "url": "https://yourmcpserver.example/pathtothemcp/url"
  }
}

Kun asetukset on tehty, tekoälyagentti voi käyttää tätä MCP:tä työkaluna ja hyödyntää kaikkia sen toimintoja. Muista vaihtaa “pubchem” MCP-palvelimesi oikeaan nimeen ja korvata URL omalla MCP-palvelimesi osoitteella.

Yhteenveto

Yllä olevien tietojen perusteella Pubchem MCP -palvelin on hyvin erikoistunut (kemiallinen/lääketieto), helppo asentaa ja integroituu MCP-asiakasohjelmiin, mutta siitä puuttuu dokumentaatio kehoteista, resursseista ja edistyneistä ominaisuuksista kuten näytteenotosta tai rootsista.

Mielipiteemme

Tämä MCP-palvelin on suoraviivainen ja toimiva tarkoitukseensa, mutta siitä puuttuu laajemmat MCP-ominaisuudet ja dokumentaatio, jotka parantaisivat sen monipuolisuutta vaativammille käyttäjille. Arvosana: 3/10.

MCP-pisteytys