Pubchem MCP-server

Vad gör “Pubchem” MCP-servern?

Pubchem MCP (Model Context Protocol) servern fungerar som en brygga mellan AI-assistenter och PubChem API:t, och möjliggör sömlös extrahering av grundläggande kemisk information om läkemedel. Genom att integrera med denna server kan AI-system automatiskt hämta molekylära detaljer, synonymer, identifierare och relaterad metadata för kemiska föreningar direkt från PubChem. Denna funktionalitet förbättrar utvecklingsflöden inom områden såsom läkemedelsupptäckt, bioinformatik och kemisk informatik genom att automatisera datahämtning, minska manuellt uppslagsarbete och möjliggöra avancerade datadrivna interaktioner i AI-drivna miljöer. Servern är designad för enkel integration och kan användas inom olika plattformar och verktyg som stödjer MCP-standarden.

Lista över promptar

Inga specifika promptmallar nämns i repositoryt.

Lista över resurser

Inga explicita resurser listas i repositoryt.

Lista över verktyg

Inga explicita verktyg beskrivs i repositoryts server.py eller synlig dokumentation.

Användningsområden för denna MCP-server

• Automatiserad hämtning av kemidata: Hämta omedelbart kemiska egenskaper, identifierare och strukturdata för valfritt läkemedel eller förening, vilket effektiviserar forsknings- och utvecklingsprocesser.
• Uppslagning av läkemedelsinformation: Ge slutanvändare eller forskare omfattande detaljer om kända läkemedel, inklusive synonymer, molekylformel och länkar till PubChem-poster.
• Integration i bioinformatiska flöden: Låt AI-drivna flöden utöka sitt datakontext med auktoritativ kemisk information för uppgifter som läkemedelsomplacering eller interaktionsanalys.
• Stöd för utbildningsverktyg: Gör det möjligt för utbildningsplattformar att erbjuda rik, realtidsbaserad kemisk information för undervisning och demonstrationer.
• API-drivna applikationer: Back-end-stöd för webb- eller mobilapplikationer som kräver uppdaterad kemidata utan manuell API-hantering.

Så här sätter du upp det

Windsurf

1. Förutsättningar: Kontrollera att Python 3.10 och beroenden (python-dotenv, requests, mcp, uvicorn) är installerade.
2. Klona och installera:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Redigera konfiguration: Öppna din Windsurf-konfiguration och lägg till Pubchem MCP-servern:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Spara och starta om: Spara dina ändringar och starta om Windsurf.
5. Verifiera: Testa genom att fråga efter ett känt läkemedel.

Claude

1. Förutsättningar: Installera Python 3.10 och nödvändiga paket.
2. Klona och installera:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Konfigurera Claude: Lägg till i din Claude Desktop servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Starta om Claude.
5. Verifiera: Fråga efter ett läkemedel för att bekräfta installationen.

Cursor

1. Förutsättningar: Python 3.10 och beroenden installerade.
2. Klona och installera:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Lägg till MCP-server: Uppdatera Cursors konfigurationsfil:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Starta om Cursor.
5. Testa: Sök efter en känd förening.

Cline

1. Förutsättningar: Installera Python 3.10 och beroenden.
2. Klona och installera:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Redigera konfiguration: Lägg till följande i din servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Starta om Cline.
5. Verifiera installationen: Bekräfta genom att köra en exempelfråga.

Säkerställa API-nycklar

Inga API-nycklar krävs för tillgång till PubChem API i nuvarande installation. Om det behövs kan miljövariabler ställas in så här:

{
  "env": {
    "PUBCHEM_API_KEY": "your_api_key"
  },
  "inputs": {}
}

Så här använder du denna MCP i flöden

Använda MCP i FlowHunt

För att integrera MCP-servrar i ditt FlowHunt-arbetsflöde, börja med att lägga till MCP-komponenten i ditt flöde och koppla den till din AI-agent:

Klicka på MCP-komponenten för att öppna konfigurationspanelen. I systemets MCP-konfigurationssektion, ange dina MCP-serverdetaljer med detta JSON-format:

{
  "pubchem": {
    "transport": "streamable_http",
    "url": "https://yourmcpserver.example/pathtothemcp/url"
  }
}

När det är konfigurerat kan AI-agenten nu använda denna MCP som ett verktyg med tillgång till alla dess funktioner och kapaciteter. Kom ihåg att ändra “pubchem” till det faktiska namnet på din MCP-server och ersätta URL:en med din egen MCP-server-URL.

Översikt

Utifrån ovanstående är Pubchem MCP-servern mycket fokuserad på ett specifikt område (kemisk/läkemedelsinfo), är enkel att installera och integreras med MCP-klienter, men saknar dokumentation kring promptar, resurser eller avancerade funktioner som sampling eller roots.

Vår åsikt

Denna MCP-server är okomplicerad och funktionell för sitt avsedda syfte, men saknar bredare MCP-funktionalitet och dokumentation som skulle göra den mer mångsidig för avancerade användare. Betyg: 3/10.

MCP-betyg