Pubchem MCP Server

Hvad gør “Pubchem” MCP Server?

Pubchem MCP (Model Context Protocol) Server fungerer som et bindeled mellem AI-assistenter og PubChem API’et, hvilket muliggør problemfri udtrækning af grundlæggende kemisk information om lægemidler. Ved integration med denne server kan AI-systemer automatisk hente molekylære detaljer, synonymer, identifikatorer og relateret metadata for kemiske forbindelser direkte fra PubChem. Denne funktionalitet forbedrer udviklingsarbejdsgange inden for områder som lægemiddelopdagelse, bioinformatik og kemisk informatik ved at automatisere dataindsamling, reducere manuelt opslagsarbejde og muliggøre avancerede datadrevne interaktioner i AI-drevne miljøer. Serveren er designet til nem integration og kan bruges på tværs af forskellige platforme og værktøjer, der understøtter MCP-standarden.

Liste over Prompts

Ingen specifikke promptskabeloner er nævnt i repositoryet.

Liste over Ressourcer

Ingen eksplicitte ressourcer er angivet i repositoryet.

Liste over Værktøjer

Ingen eksplicitte værktøjer er beskrevet i repositoryets server.py eller synlig dokumentation.

Anvendelsesmuligheder for denne MCP Server

• Automatiseret hentning af kemisk data: Hent øjeblikkeligt kemiske egenskaber, identifikatorer og strukturelle data for ethvert lægemiddel eller forbindelse og effektiviser forsknings- og udviklingsprocesser.
• Opslag af lægemiddelinformation: Giv slutbrugere eller forskere omfattende detaljer om kendte lægemidler, inkl. synonymer, molekylformel og links til PubChem-opslag.
• Integration i bioinformatikpipeline: Gør det muligt for AI-drevne pipelines at forbedre deres datakontekst med autoritativ kemisk information til fx lægemiddel-repurposing eller interaktionsanalyse.
• Støtte til uddannelsesværktøjer: Gør det muligt for uddannelsesplatforme at tilbyde rig, realtids kemisk information til undervisning og demonstrationer.
• API-drevne applikationer: Back-end support til web- eller mobilapps, der kræver opdateret kemisk data uden manuel API-håndtering.

Sådan opsætter du det

Windsurf

1. Forudsætninger: Sørg for at Python 3.10 og afhængighederne (python-dotenv, requests, mcp, uvicorn) er installeret.
2. Klon og installer:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Rediger konfiguration: Åbn din Windsurf-konfiguration og tilføj Pubchem MCP-serveren:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Gem og genstart: Gem dine ændringer og genstart Windsurf.
5. Bekræft: Test ved at forespørge på et kendt lægemiddel.

Claude

1. Forudsætninger: Installer Python 3.10 og de nødvendige pakker.
2. Klon og installer:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Konfigurer Claude: Tilføj til din Claude Desktop servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Genstart Claude.
5. Bekræft: Forespørg på et lægemiddel for at bekræfte opsætningen.

Cursor

1. Forudsætninger: Python 3.10 og afhængigheder installeret.
2. Klon og installer:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Tilføj MCP Server: Opdater Cursors konfigurationsfil:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Genstart Cursor.
5. Test: Søg efter en kendt forbindelse.

Cline

1. Forudsætninger: Installer Python 3.10 og afhængigheder.
2. Klon og installer:

   git clone https://github.com/sssjiang/pubchem_mcp_server.git
   cd pubchem_mcp_server
   pip install .
   

3. Rediger konfiguration: Tilføj følgende til din servers_config.json:

   {
     "mcpServers": {
       "pubchem": {
         "command": "uvx",
         "args": ["pubchem_mcp_server"]
       }
     }
   }
   

4. Genstart Cline.
5. Bekræft opsætning: Bekræft ved at køre en prøveforespørgsel.

Sikring af API-nøgler

Der kræves ingen API-nøgler til PubChem API-adgang i den nuværende opsætning. Hvis nødvendigt, kan miljøvariabler sættes således:

{
  "env": {
    "PUBCHEM_API_KEY": "your_api_key"
  },
  "inputs": {}
}

Sådan bruger du denne MCP i flows

Brug af MCP i FlowHunt

For at integrere MCP-servere i dit FlowHunt-arbejdsflow, skal du starte med at tilføje MCP-komponenten til dit flow og forbinde den til din AI-agent:

Klik på MCP-komponenten for at åbne konfigurationspanelet. I systemets MCP-konfigurationssektion indsætter du dine MCP-serverdetaljer med dette JSON-format:

{
  "pubchem": {
    "transport": "streamable_http",
    "url": "https://yourmcpserver.example/pathtothemcp/url"
  }
}

Når det er konfigureret, kan AI-agenten nu bruge denne MCP som et værktøj med adgang til alle dens funktioner og muligheder. Husk at ændre “pubchem” til det faktiske navn på din MCP-server og erstat URL’en med din egen MCP-server-URL.

Oversigt

Baseret på ovenstående er Pubchem MCP Server meget fokuseret på et specifikt domæne (kemisk/lægemiddelinformation), er nem at installere og integreres med MCP-klienter, men mangler dokumentation om prompts, ressourcer eller avancerede funktioner som sampling eller roots.

Vores vurdering

Denne MCP-server er ligetil og funktionel til det tiltænkte formål, men mangler bredere MCP-funktioner og dokumentation, der ville gøre den mere alsidig for avancerede brugere. Bedømmelse: 3/10.

MCP Score